普通自動二輪の教習所を合格したのですが、前の免許を紛失してしまい

普通自動二輪の教習所を合格したのですが、前の免許を紛失してしまいました。
卒業証明書もあるので、普通自動二輪をとると同時に
免許再発行はできるのでしょうか？
ちなみに山梨在住です

免許証の再発行の手続きと、普通自動2輪の手続きを同時にできるかどうかは分かりませんが、免許センターのような施設であれば本籍地の記載された住民票や印鑑、写真も必要になるかもしれませんが手続きは可能かとは思います。
あなたの地域管轄の警察署か免許センターに問い合わせてはどうでしょうか？
取りあえず最初に警察署に免許証を落としましたと、届け出を出す事をお勧めします。
もし、警察署にあなたの免許証が拾得物として届けられていれば
面倒な手間や費用を削減できますからね。