普通二輪車の免許はATとMTがありますが、AT限定はAT車しかのれませんが、M

普通二輪車の免許はATとMTがありますが、AT限定はAT車しかのれませんが、MTの免許を取得した場合AT車も乗ることができますか?

ATよりMNのほうが活躍しますよ。MNを取っておけばATにも乗れます。ATだけだとMNには乗れません。操作が違うのでAT解除しなくてはなりません。この場合はまた教習所か警察で受講です。
費用は多少MNの方が高いですが、二度手間にならないようにMNの方がオススメです。