運転免許の試験の際に必要な技能審査合格証明書の技能審査とは、

運転免許の試験の際に必要な技能審査合格証明書の技能審査とは、修了検定のことですか？
それが合格したときから有効期限を数えるんですか？

技能審査合格証明書は、ATなどの限定を解除したときに、それを証明する物です。（３ヶ月有効）
修了検定は仮免を取る時の試験ですので、別物です。（６ヶ月有効）

ちなみに卒業検定は卒業するための試験。
卒業証明書は教習所を卒業した時に貰える証明書。（１年有効）
有効期限は合格した日から数えます。

技能審査合格証明書の技能審査とは指定教習所で行う、ＡＴ限定解除等の限定解除の卒業検定と思えば良いです。
合格日から有効期限がはじまります

技能審査合格証明書は、教習所で限定解除をする場合の、卒業証明書にあたるものです。
AT限定や中型８ｔ限定が一般的ですね。
限定付きとはいえ、既に当該運転免許を持っているわけですから、
「卒業」や「試験」という言い方はしません。
「審査」という言い方をしています。
ちなみに卒業証明書と異なり、有効期限は３か月です。

技能審査とは限定解除など（例：オートマチック限定解除・普通自動二輪車小型限定解除）を指します。
修了検定とは自動車教習所内で行うものを指し、運転免許試験においては実技試験に相当します。
検定の合格証明書を持っていれば実技試験が免除となりますが、修了検定合格証明書については検定合格日から３ケ月の有効期間しかありません。

そうですよ。その通り。