現在、原付免許で点数が１点しか残ってないです。しかし、先月に中免を取り

現在、原付免許で点数が１点しか残ってないです。しかし、先月に中免を取りました。点数は免許毎に違うのでしょうか?
もし、点数が合計の場合、残りの点数は何点になるのでしょうか?

全ての違反点数は合算されますが、初心者特例の点数は別に計算されます。
違反点数は累積・加算制度なので、今までの違反暦・前歴・累積点数が分からなければ、あと１点でどの様の処分になるか分かりません。

中免？ 普通二輪免許ですよね（笑）
どんな免許を所得しても加算されて来ますから次に違反をしたら免停になります。
残りの点数とかではなくて違反に応じて違反点数が加算されていきます。
免停になると前歴になり免停になる点数が少なくなります。
また前歴の回数に応じて免停、取り消しの点数が少なくなります。
新たに普通二輪免許や大型二輪免許、普通免許を所得するとその免許に応じて一年間の間は初心運転者期間もありますので気を付けて。
前歴、違反点数をリセットするには、最後の違反から一年間無事故、無違反で無ければ違反点数や前歴をリセットできません。

原付に乗っていて残り1点ということは、違反が重なって5点加点されているということですか。
自動二輪の免許を取ったということですが、貴方の免許証は一枚しかないのです。
一枚の免許証に原付と自動二輪が併記されていますので、後1点で30日の免停ということになりますね。