仕事上大型免許を取得しましたが、もし普通車種で違反をすると、

仕事上 大型免許を取得しましたが、もし普通車種で違反をすると、
大型免許での反則きっぷを切られるのでしょうか？
よろしくお願いします！

普通と大型では反則金の金額が違う例が多いです。
当然ですが、大型を運転していて違反すれば大型の反則キップ
普通車を運転していて違反すれば、普通車の反則キップです。
大型免許で普通車運転で違反して、大型の反則金額なんてありえませんよ。

ご質問を、二通りの意味に解釈いたしました。
まず、普通車で違反したときに、大型車の反則金が適用されるのか、という意味のご質問であれば、大丈夫です。普通車での反則金になります。
次に、普通車での違反は、大型免許の点数に影響するのか、という意味のご質問であれば、影響します。
点数制度は、運転時の車種に応じて課されるものではなく、運転者に課されるものです。
なので、例えば普通車で違反した点数が６点に達すると、運転者のあなたに免許停止の処分がなされるので、あなたは大型車も運転できなくなります。

大型、普通、免許は一枚ですのでどちらで違反しても合算されます。（大型で違反すると罰金や点数に違いがあります）
免停になればどちらも乗れませんし、取消になったら両方とも取り直しになります。

私は以前、中型バイクの免許とりたてで、車に乗っていたときの事故で免停になりました。
その間はもちろんバイクも乗れず、原付も乗れませんでした。
結局、大型とろうが１枚の免許証なので一緒ですよ。