駐車違反をしてしまいました。出頭しないで反則金を支払うつもりでいます。免許

駐車違反をしてしまいました。出頭しないで反則金を支払うつもりでいます。免許に傷がつかないのはわかりましたが会社にSDカードの提出を義務付けられています。SDカードにこの違反の履歴は残るのでしょうか？
明日車両通勤の許可書を提出する予定です。SDカードの申請も明日する予定です。ちなみに車両の所有者は私となっています。

「放置車両確認標章」の黄色のステッカーを貼られたのならば放置駐車違反になります。
放置駐車違反は出頭をしないでいれば、放置違反金の納付書が車両の所有者に送られてきます。この場合は、違反者が特定できずに車両の所有者に責任を追求するもので、免許証には全く影響はありません。
SDカードは免許証の無事故・無違反を証明するものなので、放置駐車違反を違反金で納付しても免許証には無関係なので、SDカードには無事故・無違反で継続となります。

違反歴が残っていなければSDカードは発行されます

それは無いでしょ。
免許に違反経歴が残らないのにＳＤにだけ残るとは思いません。