例えば所持免許が普通大型普通自動二輪大型二輪だとして、普通車で派手に違反して

例えば所持免許が
普通
大型
普通自動二輪
大型二輪
だとして、普通車で派手に違反して免許取り消しになったら、他の免許も同時に全て無くなるのですか？

当然です。
私の知り合いに、「大型二種」免許所持者が、原付の違反のみで免許取り消しになった人が居ます。

はい、見事に全てなくなります！