免許を取って、3年、今年初めて、切り替えをするんですが、取って約

免許を取って、3年、今年初めて、切り替えをするんですが、取って約2年間ほとんど運転しませんでした。申請するときにペーパーであることを伝えなけれなならないですか？滋賀の守山免許センターまで行きます。

ペーパーであることを伝えなければならないことはありませんが、誰に伝えようとしているのでしょうか？
あなたがペーパーだろうが、なかろうが、免許センターの人はそんなこと興味ないと思いますので、伝えない方が賢明かと思います。

申告は不要ですが、申告したいのですか？

運転歴の有無は関係ないです。ペーパーや車の有無に関わらず無事故無違反を続ければゴールドになります。

ペーパードライバーだからと言って、免許更新日に申告する必要は無いです。